RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
Main Page
Namespaces
Classes
Files
Class List
Class Hierarchy
Class Members
Class Index
A
|
B
|
C
|
D
|
E
|
F
|
G
|
H
|
I
|
K
|
L
|
M
|
N
|
O
|
P
|
Q
|
R
|
S
|
T
|
U
|
V
|
X
A
EmbeddedFrag
(
RDDepict
)
LessEqualQuery
(
Queries
)
MolPicklerException
(
RDKit
)
SmilesParseException
(
RDKit
)
EqualityQuery
(
Queries
)
LessQuery
(
Queries
)
MolSanitizeException
(
RDKit
)
SmilesWriter
(
RDKit
)
AdjustQueryParameters
(
RDKit::MolOps
)
ExclusionList
(
RDKit
)
LinearCatalog
(
RDCatalog
)
MolStackElem
(
RDKit::Canon
)
SparseBitVect
And
(
RDKit::FilterMatchOps
)
ExecStatistics
(
RDKit::FMCS
)
LocaleSwitcher
(
RDKit::Utils
)
MolStackUnion
(
RDKit::Canon
)
SparseIntVect
(
RDKit
)
AndQuery
(
Queries
)
ExplicitBitVect
M
MolSupplier
(
RDKit
)
SpecialChiralityAtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
AngleBendContrib
(
ForceFields::MMFF
)
ExplicitFeature
(
RDFeatures
)
MolWriter
(
RDKit
)
SpecialSymmetryAtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
AngleBendContrib
(
ForceFields::UFF
)
F
MatchingAtomIterator_
(
RDKit
)
N
SquareMatrix
(
RDNumeric
)
AngleConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
Matrix
(
RDNumeric
)
StretchBendContrib
(
ForceFields::MMFF
)
AngleConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
FeatureFileParseException
(
RDKit
)
MaximumCommonSubgraph
(
RDKit::FMCS
)
NewBond
(
RDKit::FMCS
)
SubstructureCache
(
RDKit::FMCS
)
AromaticAtomIterator_
(
RDKit
)
FileParseException
(
RDKit
)
MaxMinPicker
(
RDPickers
)
Not
(
RDKit::FilterMatchOps
)
SymmMatrix
(
RDNumeric
)
Atom
(
RDKit
)
FilterCatalog
(
RDKit
)
MCSAtomCompareParameters
(
RDKit
)
O
T
AtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
FilterCatalogEntry
(
RDKit
)
MCSBondCompareParameters
(
RDKit
)
AtomicParams
(
ForceFields::UFF
)
FilterCatalogParams
(
RDKit
)
MCSParameters
(
RDKit
)
O3A
(
RDKit::MolAlign
)
Target
(
RDKit::FMCS
)
AtomIterator_
(
RDKit
)
FilterData_t
(
RDKit
)
MCSProgressData
(
RDKit
)
O3AConstraint
(
RDKit::MolAlign
)
TargetMatch
(
RDKit::FMCS
)
AtomMonomerInfo
(
RDKit
)
FilterMatch
(
RDKit
)
MCSResult
(
RDKit
)
O3AConstraintVect
(
RDKit::MolAlign
)
TArray2D
(
RDKit::FMCS
)
AtomPDBResidueInfo
(
RDKit
)
FilterMatcherBase
(
RDKit
)
MetricMatrixCalc
(
RDDataManip
)
O3AFuncData
(
RDKit::MolAlign
)
TDTMolSupplier
(
RDKit
)
AtomRingQuery
(
RDKit
)
FilterProperty_t
(
RDKit
)
MMFFAngle
(
ForceFields::MMFF
)
OopBendContrib
(
ForceFields::MMFF
)
TDTWriter
(
RDKit
)
AttribType
(
RDKit::SLNParse
)
ForceField
(
ForceFields
)
MMFFAngleCollection
(
ForceFields::MMFF
)
Or
(
RDKit::FilterMatchOps
)
DuplicatedSeedCache::TKey
(
RDKit::FMCS
)
B
ForceFieldContrib
(
ForceFields
)
MMFFAromCollection
(
ForceFields::MMFF
)
OrQuery
(
Queries
)
TorsionAngleContrib
(
ForceFields::MMFF
)
ForwardSDMolSupplier
(
RDKit
)
MMFFAtomProperties
(
RDKit::MMFF
)
P
TorsionAngleContrib
(
ForceFields::UFF
)
BadFileException
(
RDKit
)
FourthDimContrib
(
DistGeom
)
MMFFBndkCollection
(
ForceFields::MMFF
)
TorsionAngleContribM6
(
ForceFields::CrystalFF
)
BitCorrMatGenerator
(
RDInfoTheory
)
FPBReader
(
RDKit
)
MMFFBond
(
ForceFields::MMFF
)
ParamCollection
(
ForceFields::UFF
)
TorsionConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
BitVect
FragCatalogEntry
(
RDKit
)
MMFFBondCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PDBMolSupplier
(
RDKit
)
TorsionConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
Bond
(
RDKit
)
FragCatGenerator
(
RDKit
)
MMFFChg
(
ForceFields::MMFF
)
PDBWriter
(
RDKit
)
Transform2D
(
RDGeom
)
BondIterator_
(
RDKit
)
FragCatParams
(
RDKit
)
MMFFChgCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PeriodicTable
(
RDKit
)
Transform3D
(
RDGeom
)
BondStretchContrib
(
ForceFields::MMFF
)
FragFPGenerator
(
RDKit
)
MMFFCovRadPauEle
(
ForceFields::MMFF
)
Point
(
RDGeom
)
U
BondStretchContrib
(
ForceFields::UFF
)
FragmenterBondType
(
RDKit::MolFragmenter
)
MMFFCovRadPauEleCollection
(
ForceFields::MMFF
)
Point2D
(
RDGeom
)
BoundsMatrix
(
DistGeom
)
FreeChemicalFeature
(
ChemicalFeatures
)
MMFFDef
(
ForceFields::MMFF
)
Point3D
(
RDGeom
)
UFFAngle
(
ForceFields::UFF
)
C
G
MMFFDefCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PointND
(
RDGeom
)
UFFBond
(
ForceFields::UFF
)
MMFFDfsbCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PositionConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
UFFInv
(
ForceFields::UFF
)
Catalog
(
RDCatalog
)
GasteigerParams
(
RDKit
)
MMFFHerschbachLaurie
(
ForceFields::MMFF
)
PositionConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
UFFTor
(
ForceFields::UFF
)
CatalogEntry
(
RDCatalog
)
Graph
(
RDKit::FMCS
)
MMFFHerschbachLaurieCollection
(
ForceFields::MMFF
)
PySequenceHolder
UFFVdW
(
ForceFields::UFF
)
CatalogParams
(
RDCatalog
)
GreaterEqualQuery
(
Queries
)
MMFFMolProperties
(
RDKit::MMFF
)
Q
UniformGrid3D
(
RDGeom
)
ChemicalFeature
(
ChemicalFeatures
)
GreaterQuery
(
Queries
)
MMFFOop
(
ForceFields::MMFF
)
V
ChemicalReaction
(
RDKit
)
Grid3D
(
RDGeom
)
MMFFOopCollection
(
ForceFields::MMFF
)
Query
(
Queries
)
ChemicalReactionException
(
RDKit
)
GridException
(
RDGeom
)
MMFFPBCI
(
ForceFields::MMFF
)
QueryAtom
(
RDKit
)
ValueErrorException
ChemicalReactionParserException
(
RDKit
)
H
MMFFPBCICollection
(
ForceFields::MMFF
)
QueryAtomIterator_
(
RDKit
)
VdWContrib
(
ForceFields::MMFF
)
ChiralAtomCompareFunctor
(
RDKit::Canon
)
MMFFProp
(
ForceFields::MMFF
)
QueryBond
(
RDKit
)
Vector
(
RDNumeric
)
ChiralSet
(
DistGeom
)
SubstructureCache::HashKey
(
RDKit::FMCS
)
MMFFPropCollection
(
ForceFields::MMFF
)
R
X
ChiralViolationContrib
(
DistGeom
)
HashSet
(
RDKit::MolHash
)
MMFFStbn
(
ForceFields::MMFF
)
Composition2N
(
RDKit::FMCS
)
HasPropQuery
(
RDKit
)
MMFFStbnCollection
(
ForceFields::MMFF
)
RangeQuery
(
Queries
)
XOrQuery
(
Queries
)
Conformer
(
RDKit
)
HasPropWithValueQuery
(
RDKit
)
MMFFTor
(
ForceFields::MMFF
)
ReactionFingerprintParams
(
RDKit
)
a
ConformerException
(
RDKit
)
HasPropWithValueQuery< TargetPtr, std::string >
(
RDKit
)
MMFFTorCollection
(
ForceFields::MMFF
)
ReactionPickler
(
RDKit
)
ConstBondIterator_
(
RDKit
)
HeteroatomIterator_
(
RDKit
)
MMFFVdW
(
ForceFields::MMFF
)
ReactionPicklerException
(
RDKit
)
argless
(
Rankers
)
CrippenParamCollection
(
RDKit::Descriptors
)
HierarchCatalog
(
RDCatalog
)
MMFFVdWCollection
(
ForceFields::MMFF
)
RecursiveStructureQuery
(
RDKit
)
atomicData
(
RDKit
)
CrippenParams
(
RDKit::Descriptors
)
HierarchicalClusterPicker
(
RDPickers
)
MMFFVdWRijstarEps
(
ForceFields::MMFF
)
ResonanceMolSupplier
(
RDKit
)
b
D
I
MolAlignException
(
RDKit::MolAlign
)
RingInfo
(
RDKit
)
MolCatalogEntry
(
RDKit
)
RingMatchTableSet
(
RDKit::FMCS
)
bondholder
(
RDKit::Canon
)
DatastructsException
ImplicitFeature
(
RDFeatures
)
MolCatalogParams
(
RDKit
)
ROMol
(
RDKit
)
c
Dict
(
RDKit
)
IndexErrorException
MolChemicalFeature
(
RDKit
)
RWMol
(
RDKit
)
DiscreteDistMat
(
RDKit
)
InfoBitRanker
(
RDInfoTheory
)
MolChemicalFeatureDef
(
RDKit
)
S
canon_atom
(
RDKit::Canon
)
DiscreteValueVect
(
RDKit
)
Int2Type
(
Queries
)
MolChemicalFeatureFactory
(
RDKit
)
charptr_functor
(
RDKit
)
DistanceConstraintContrib
(
ForceFields::MMFF
)
Invariant
(
Invar
)
MolDraw2D
(
RDKit
)
SDM
(
RDKit::MolAlign
)
g
DistanceConstraintContrib
(
ForceFields::UFF
)
InversionContrib
(
ForceFields::UFF
)
MolDraw2DCairo
(
RDKit
)
SDMolSupplier
(
RDKit
)
DistPicker
(
RDPickers
)
K
MolDraw2DQt
(
RDKit
)
SDWriter
(
RDKit
)
gtIIPair
(
RDDepict
)
DistViolationContrib
(
DistGeom
)
MolDraw2DSVG
(
RDKit
)
Seed
(
RDKit::FMCS
)
i
DuplicatedSeedCache
(
RDKit::FMCS
)
KeyErrorException
MolDraw2Dwx
(
RDKit
)
SeedSet
(
RDKit::FMCS
)
E
SubstructureCache::KeyNumericMetrics
(
RDKit::FMCS
)
MolDrawOptions
(
RDKit
)
SetQuery
(
Queries
)
streambuf::istream
(
boost_adaptbx::python
)
L
MolFragment
(
RDKit::FMCS
)
SLNParseException
(
RDKit
)
l
EleContrib
(
ForceFields::MMFF
)
MolHistogram
(
RDKit::MolAlign
)
SmartsMatcher
(
RDKit
)
EmbeddedAtom
(
RDDepict
)
LAP
(
RDKit::MolAlign
)
MolPickler
(
RDKit
)
SmilesMolSupplier
(
RDKit
)
larger_of
(
RDKit
)
A
|
B
|
C
|
D
|
E
|
F
|
G
|
H
|
I
|
K
|
L
|
M
|
N
|
O
|
P
|
Q
|
R
|
S
|
T
|
U
|
V
|
X
Generated on Mon Apr 18 2016 07:20:53 for RDKit by
1.8.9.1