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• AAMatch() : RDKit::StructureCheck
• ActivatePartitions() : RDKit::Canon
• addAngles() : RDKit::MMFF::Tools , RDKit::UFF::Tools
• addAtomChargeFlags() : RDKit::UFF::Tools
• addAtomToMol() : RDKit::SLNParse
• addBonds() : RDKit::MMFF::Tools , RDKit::UFF::Tools
• addBranchToMol() : RDKit::SLNParse
• addEle() : RDKit::MMFF::Tools
• addFragToMol() : RDKit::SLNParse
• AddFragToMol() : SmilesParseOps
• addHs() : RDKit::MolOps
• addInversions() : RDKit::UFF::Tools
• AddMWMF() : RDKit::StructureCheck
• addNonbonded() : RDKit::UFF::Tools
• addOop() : RDKit::MMFF::Tools
• addRecursiveQueries() : RDKit
• addRecursiveQueriesToReaction() : RDKit
• addStretchBend() : RDKit::MMFF::Tools
• addTorsions() : RDKit::MMFF::Tools , RDKit::UFF::Tools
• addVdW() : RDKit::MMFF::Tools
• adjustAtomChiralities() : RDKit::SLNParse
• AdjustAtomChiralityFlags() : SmilesParseOps
• adjustHs() : RDKit::MolOps
• adjustQueryProperties() : RDKit::MolOps
• adjustTemplates() : RDKit::RxnOps
• alignMol() : RDKit::MolAlign
• alignMolConformers() : RDKit::MolAlign
• AlignPoints() : RDNumeric::Alignments
• appendPackedIntToStream() : RDKit
• arcPoints() : RDKit::MolDraw2D_detail
• areAtomsInSameAromaticRing() : RDKit::MMFF
• areAtomsInSameRingOfSize() : RDKit::MMFF
• assignBWPalette() : RDKit
• assignChiralTypesFrom3D() : RDKit::MolOps
• assignDefaultPalette() : RDKit
• assignRadicals() : RDKit::MolOps
• assignStereochemistry() : RDKit::MolOps
• assignStereochemistryFrom3D() : RDKit::MolOps
• AtomClash() : RDKit::StructureCheck
• atomCompat() : RDKit
• atomHasConjugatedBond() : RDKit::MolOps
• AtomParity() : RDKit::StructureCheck
• AtomSymbolMatch() : RDKit::StructureCheck