Python Module Index

r


	r
	`rdkit`
	`rdkit.Chem`
	`rdkit.Chem.AllChem`
	`rdkit.Chem.AtomPairs`
	`rdkit.Chem.AtomPairs.Pairs`
	`rdkit.Chem.AtomPairs.Sheridan`
	`rdkit.Chem.AtomPairs.test_list`
	`rdkit.Chem.AtomPairs.Torsions`
	`rdkit.Chem.AtomPairs.UnitTestDescriptors`
	`rdkit.Chem.AtomPairs.Utils`
	`rdkit.Chem.BRICS`
	`rdkit.Chem.BuildFragmentCatalog`
	`rdkit.Chem.ChemicalFeatures`
	`rdkit.Chem.ChemicalForceFields`
	`rdkit.Chem.ChemUtils`
	`rdkit.Chem.ChemUtils.AlignDepict`
	`rdkit.Chem.ChemUtils.BulkTester`
	`rdkit.Chem.ChemUtils.SDFToCSV`
	`rdkit.Chem.ChemUtils.TemplateExpand`
	`rdkit.Chem.ChemUtils.test_list`
	`rdkit.Chem.ChemUtils.UnitTestAlignDepict`
	`rdkit.Chem.ChemUtils.UnitTestSDFToCSV`
	`rdkit.Chem.Crippen`
	`rdkit.Chem.Descriptors`
	`rdkit.Chem.Descriptors3D`
	`rdkit.Chem.Draw`
	`rdkit.Chem.Draw.cairoCanvas`
	`rdkit.Chem.Draw.canvasbase`
	`rdkit.Chem.Draw.IPythonConsole`
	`rdkit.Chem.Draw.MolDrawing`
	`rdkit.Chem.Draw.mplCanvas`
	`rdkit.Chem.Draw.SimilarityMaps`
	`rdkit.Chem.Draw.spingCanvas`
	`rdkit.Chem.Draw.test_list`
	`rdkit.Chem.Draw.UnitTestDraw`
	`rdkit.Chem.Draw.UnitTestIPython`
	`rdkit.Chem.Draw.UnitTestSimilarityMaps`
	`rdkit.Chem.EState`
	`rdkit.Chem.EState.AtomTypes`
	`rdkit.Chem.EState.EState`
	`rdkit.Chem.EState.EState_VSA`
	`rdkit.Chem.EState.Fingerprinter`
	`rdkit.Chem.EState.test_list`
	`rdkit.Chem.EState.UnitTestEState`
	`rdkit.Chem.EState.UnitTestFingerprints`
	`rdkit.Chem.EState.UnitTestTypes`
	`rdkit.Chem.EState.UnitTestVSA`
	`rdkit.Chem.FastSDMolSupplier`
	`rdkit.Chem.FeatFinderCLI`
	`rdkit.Chem.FeatMaps`
	`rdkit.Chem.FeatMaps.FeatMapParser`
	`rdkit.Chem.FeatMaps.FeatMapPoint`
	`rdkit.Chem.FeatMaps.FeatMaps`
	`rdkit.Chem.FeatMaps.FeatMapUtils`
	`rdkit.Chem.FeatMaps.test_list`
	`rdkit.Chem.FeatMaps.UnitTestFeatMap`
	`rdkit.Chem.FeatMaps.UnitTestFeatMapParser`
	`rdkit.Chem.FeatMaps.UnitTestFeatMapPoint`
	`rdkit.Chem.FeatMaps.UnitTestFeatMapUtils`
	`rdkit.Chem.Features`
	`rdkit.Chem.Features.FeatDirUtilsRD`
	`rdkit.Chem.Features.ShowFeats`
	`rdkit.Chem.FilterCatalog`
	`rdkit.Chem.Fingerprints`
	`rdkit.Chem.Fingerprints.ClusterMols`
	`rdkit.Chem.Fingerprints.DbFpSupplier`
	`rdkit.Chem.Fingerprints.FingerprintMols`
	`rdkit.Chem.Fingerprints.MolSimilarity`
	`rdkit.Chem.Fingerprints.SimilarityScreener`
	`rdkit.Chem.Fingerprints.test_list`
	`rdkit.Chem.Fingerprints.UnitTestDbFpSupplier`
	`rdkit.Chem.Fingerprints.UnitTestFingerprints`
	`rdkit.Chem.Fingerprints.UnitTestSimScreener`
	`rdkit.Chem.fmcs`
	`rdkit.Chem.fmcs.fmcs`
	`rdkit.Chem.Fraggle`
	`rdkit.Chem.Fraggle.FraggleSim`
	`rdkit.Chem.Fraggle.test_list`
	`rdkit.Chem.Fraggle.UnitTestFraggle`
	`rdkit.Chem.FragmentCatalog`
	`rdkit.Chem.FragmentMatcher`
	`rdkit.Chem.Fragments`
	`rdkit.Chem.FunctionalGroups`
	`rdkit.Chem.GraphDescriptors`
	`rdkit.Chem.Graphs`
	`rdkit.Chem.inchi`
	`rdkit.Chem.Lipinski`
	`rdkit.Chem.MACCSkeys`
	`rdkit.Chem.MCS`
	`rdkit.Chem.MolCatalog`
	`rdkit.Chem.MolDb`
	`rdkit.Chem.MolDb.FingerprintUtils`
	`rdkit.Chem.MolDb.Loader`
	`rdkit.Chem.MolDb.Loader_orig`
	`rdkit.Chem.MolDb.Loader_sa`
	`rdkit.Chem.MolKey`
	`rdkit.Chem.MolKey.InchiInfo`
	`rdkit.Chem.MolKey.MolKey`
	`rdkit.Chem.MolKey.test_list`
	`rdkit.Chem.MolKey.UnitTestMolKey`
	`rdkit.Chem.MolSurf`
	`rdkit.Chem.PandasTools`
	`rdkit.Chem.PeriodicTable`
	`rdkit.Chem.Pharm2D`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.Generate`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.Gobbi_Pharm2D`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.Matcher`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.SigFactory`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.test_list`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.UnitTestGenerate`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.UnitTestGobbi`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.UnitTestLazyGenerator`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.UnitTestMatcher`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.UnitTestSignature`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.UnitTestUtils`
	`rdkit.Chem.Pharm2D.Utils`
	`rdkit.Chem.Pharm3D`
	`rdkit.Chem.Pharm3D.EmbedLib`
	`rdkit.Chem.Pharm3D.ExcludedVolume`
	`rdkit.Chem.Pharm3D.Pharmacophore`
	`rdkit.Chem.Pharm3D.test_list`
	`rdkit.Chem.Pharm3D.UnitTestEmbed`
	`rdkit.Chem.Pharm3D.UnitTestExcludedVolume`
	`rdkit.Chem.Pharm3D.UnitTestPharmacophore`
	`rdkit.Chem.PropertyMol`
	`rdkit.Chem.PyMol`
	`rdkit.Chem.Randomize`
	`rdkit.Chem.rdchem`
	`rdkit.Chem.rdmolops`
	`rdkit.Chem.Recap`
	`rdkit.Chem.ReducedGraphs`
	`rdkit.Chem.SaltRemover`
	`rdkit.Chem.SATIS`
	`rdkit.Chem.Scaffolds`
	`rdkit.Chem.Scaffolds.MurckoScaffold`
	`rdkit.Chem.Scaffolds.test_list`
	`rdkit.Chem.Scaffolds.UnitTestMurckoScaffold`
	`rdkit.Chem.ShowMols`
	`rdkit.Chem.SimpleEnum`
	`rdkit.Chem.SimpleEnum.Enumerator`
	`rdkit.Chem.SimpleEnum.test_list`
	`rdkit.Chem.SimpleEnum.UnitTestEnumerator`
	`rdkit.Chem.Subshape`
	`rdkit.Chem.Subshape.BuilderUtils`
	`rdkit.Chem.Subshape.SubshapeAligner`
	`rdkit.Chem.Subshape.SubshapeBuilder`
	`rdkit.Chem.Subshape.SubshapeObjects`
	`rdkit.Chem.Subshape.test_list`
	`rdkit.Chem.Subshape.UnitTestSubshape`
	`rdkit.Chem.Suppliers`
	`rdkit.Chem.Suppliers.DbMolSupplier`
	`rdkit.Chem.Suppliers.MolSupplier`
	`rdkit.Chem.Suppliers.test_list`
	`rdkit.Chem.Suppliers.UnitTestDbMolSupplier`
	`rdkit.Chem.Suppliers.UnitTestSDMolSupplier`
	`rdkit.Chem.Suppliers.UnitTestSmilesMolSupplier`
	`rdkit.Chem.TemplateAlign`
	`rdkit.Chem.test_list`
	`rdkit.Chem.TorsionFingerprints`
	`rdkit.Chem.UnitTestCatalog`
	`rdkit.Chem.UnitTestChem`
	`rdkit.Chem.UnitTestChemAtom`
	`rdkit.Chem.UnitTestChemBond`
	`rdkit.Chem.UnitTestChemSmarts`
	`rdkit.Chem.UnitTestChemv2`
	`rdkit.Chem.UnitTestCrippen`
	`rdkit.Chem.UnitTestDescriptors`
	`rdkit.Chem.UnitTestDocTestsChem`
	`rdkit.Chem.UnitTestFeatFinderCLI`
	`rdkit.Chem.UnitTestFragmentDescriptors`
	`rdkit.Chem.UnitTestFunctionalGroups`
	`rdkit.Chem.UnitTestGraphDescriptors_2`
	`rdkit.Chem.UnitTestInchi`
	`rdkit.Chem.UnitTestLipinski`
	`rdkit.Chem.UnitTestMCS`
	`rdkit.Chem.UnitTestMol3D`
	`rdkit.Chem.UnitTestOldBugs`
	`rdkit.Chem.UnitTestPandasTools`
	`rdkit.Chem.UnitTestPeriodicTable`
	`rdkit.Chem.UnitTestSATIS`
	`rdkit.Chem.UnitTestSmiles`
	`rdkit.Chem.UnitTestSuppliers`
	`rdkit.Chem.UnitTestSurf`
	`rdkit.DataManip`
	`rdkit.DataManip.Metric`
	`rdkit.DataStructs`
	`rdkit.DataStructs.BitEnsemble`
	`rdkit.DataStructs.BitEnsembleDb`
	`rdkit.DataStructs.BitUtils`
	`rdkit.DataStructs.LazySignature`
	`rdkit.DataStructs.test_list`
	`rdkit.DataStructs.TopNContainer`
	`rdkit.DataStructs.UnitTestBitEnsemble`
	`rdkit.DataStructs.UnitTestcBitVect`
	`rdkit.DataStructs.UnitTestDocTests`
	`rdkit.DataStructs.UnitTestTopNContainer`
	`rdkit.DataStructs.VectCollection`
	`rdkit.Dbase`
	`rdkit.Dbase.DbConnection`
	`rdkit.Dbase.DbInfo`
	`rdkit.Dbase.DbModule`
	`rdkit.Dbase.DbReport`
	`rdkit.Dbase.DbResultSet`
	`rdkit.Dbase.DbUtils`
	`rdkit.Dbase.StorageUtils`
	`rdkit.Dbase.test_list`
	`rdkit.Dbase.UnitTestDbConnect`
	`rdkit.Dbase.UnitTestDbInfo`
	`rdkit.Dbase.UnitTestDbResultSet`
	`rdkit.Dbase.UnitTestDbUtils`
	`rdkit.Dbase.UnitTestStorageUtils`
	`rdkit.DistanceGeometry`
	`rdkit.ForceField`
	`rdkit.Geometry`
	`rdkit.ML`
	`rdkit.ML.AnalyzeComposite`
	`rdkit.ML.BuildComposite`
	`rdkit.ML.Cluster`
	`rdkit.ML.Cluster.Butina`
	`rdkit.ML.Cluster.Clusters`
	`rdkit.ML.Cluster.ClusterUtils`
	`rdkit.ML.Cluster.ClusterVis`
	`rdkit.ML.Cluster.Murtagh`
	`rdkit.ML.Cluster.murtagh_test`
	`rdkit.ML.Cluster.Resemblance`
	`rdkit.ML.Cluster.Standardize`
	`rdkit.ML.Cluster.test_list`
	`rdkit.ML.Cluster.UnitTestButina`
	`rdkit.ML.Cluster.UnitTestCluster`
	`rdkit.ML.Composite`
	`rdkit.ML.Composite.AdjustComposite`
	`rdkit.ML.Composite.BayesComposite`
	`rdkit.ML.Composite.Composite`
	`rdkit.ML.Composite.test_list`
	`rdkit.ML.Composite.UnitTestComposite`
	`rdkit.ML.Composite.UnitTestCOMServer`
	`rdkit.ML.CompositeRun`
	`rdkit.ML.Data`
	`rdkit.ML.Data.DataUtils`
	`rdkit.ML.Data.FindQuantBounds`
	`rdkit.ML.Data.MLData`
	`rdkit.ML.Data.Quantize`
	`rdkit.ML.Data.SplitData`
	`rdkit.ML.Data.Stats`
	`rdkit.ML.Data.test_list`
	`rdkit.ML.Data.Transforms`
	`rdkit.ML.Data.UnitTestDoctests`
	`rdkit.ML.Data.UnitTestFilter`
	`rdkit.ML.Data.UnitTestMLData`
	`rdkit.ML.Data.UnitTestQuantize`
	`rdkit.ML.Data.UnitTestStats`
	`rdkit.ML.DecTree`
	`rdkit.ML.DecTree.BuildQuantTree`
	`rdkit.ML.DecTree.BuildSigTree`
	`rdkit.ML.DecTree.CrossValidate`
	`rdkit.ML.DecTree.DecTree`
	`rdkit.ML.DecTree.Forest`
	`rdkit.ML.DecTree.ID3`
	`rdkit.ML.DecTree.PruneTree`
	`rdkit.ML.DecTree.QuantTree`
	`rdkit.ML.DecTree.randomtest`
	`rdkit.ML.DecTree.SigTree`
	`rdkit.ML.DecTree.test_list`
	`rdkit.ML.DecTree.Tree`
	`rdkit.ML.DecTree.TreeUtils`
	`rdkit.ML.DecTree.TreeVis`
	`rdkit.ML.DecTree.UnitTestID3`
	`rdkit.ML.DecTree.UnitTestPrune`
	`rdkit.ML.DecTree.UnitTestQuantTree`
	`rdkit.ML.DecTree.UnitTestSigTree`
	`rdkit.ML.DecTree.UnitTestTree`
	`rdkit.ML.DecTree.UnitTestTreeUtils`
	`rdkit.ML.DecTree.UnitTestXVal`
	`rdkit.ML.Descriptors`
	`rdkit.ML.Descriptors.CompoundDescriptors`
	`rdkit.ML.Descriptors.Descriptors`
	`rdkit.ML.Descriptors.MoleculeDescriptors`
	`rdkit.ML.Descriptors.Parser`
	`rdkit.ML.Descriptors.test_list`
	`rdkit.ML.Descriptors.UnitTestCOMServer`
	`rdkit.ML.Descriptors.UnitTestDescriptors`
	`rdkit.ML.Descriptors.UnitTestMolDescriptors`
	`rdkit.ML.Descriptors.UnitTestParser`
	`rdkit.ML.EnrichPlot`
	`rdkit.ML.files`
	`rdkit.ML.GrowComposite`
	`rdkit.ML.InfoTheory`
	`rdkit.ML.InfoTheory.BitClusterer`
	`rdkit.ML.InfoTheory.BitRank`
	`rdkit.ML.InfoTheory.entropy`
	`rdkit.ML.InfoTheory.test_list`
	`rdkit.ML.InfoTheory.UnitTestBitRanker`
	`rdkit.ML.InfoTheory.UnitTestCorrMatGen`
	`rdkit.ML.KNN`
	`rdkit.ML.KNN.CrossValidate`
	`rdkit.ML.KNN.DistFunctions`
	`rdkit.ML.KNN.KNNClassificationModel`
	`rdkit.ML.KNN.KNNModel`
	`rdkit.ML.KNN.KNNRegressionModel`
	`rdkit.ML.KNN.test_list`
	`rdkit.ML.KNN.UnitTestKNN`
	`rdkit.ML.MatOps`
	`rdkit.ML.MLUtils`
	`rdkit.ML.MLUtils.VoteImg`
	`rdkit.ML.ModelPackage`
	`rdkit.ML.ModelPackage.Packager`
	`rdkit.ML.ModelPackage.PackageUtils`
	`rdkit.ML.ModelPackage.test_list`
	`rdkit.ML.ModelPackage.UnitTestPackage`
	`rdkit.ML.NaiveBayes`
	`rdkit.ML.NaiveBayes.ClassificationModel`
	`rdkit.ML.NaiveBayes.CrossValidate`
	`rdkit.ML.NaiveBayes.test_list`
	`rdkit.ML.NaiveBayes.UnitTestNB`
	`rdkit.ML.Neural`
	`rdkit.ML.Neural.ActFuncs`
	`rdkit.ML.Neural.CrossValidate`
	`rdkit.ML.Neural.NetNode`
	`rdkit.ML.Neural.Network`
	`rdkit.ML.Neural.test_list`
	`rdkit.ML.Neural.Trainers`
	`rdkit.ML.Neural.UnitTestOther`
	`rdkit.ML.Neural.UnitTestTrainer`
	`rdkit.ML.Scoring`
	`rdkit.ML.Scoring.Scoring`
	`rdkit.ML.Scoring.test_list`
	`rdkit.ML.Scoring.UnitTestScoring`
	`rdkit.ML.ScreenComposite`
	`rdkit.ML.SLT`
	`rdkit.ML.SLT.Risk`
	`rdkit.ML.SLT.test_list`
	`rdkit.ML.SLT.UnitTestRisk`
	`rdkit.ML.test_list`
	`rdkit.ML.UnitTestAnalyzeComposite`
	`rdkit.ML.UnitTestBuildComposite`
	`rdkit.ML.UnitTestScreenComposite`
	`rdkit.Numerics`
	`rdkit.RDConfig`
	`rdkit.RDLogger`
	`rdkit.RDPaths`
	`rdkit.RDRandom`
	`rdkit.SimDivFilters`
	`rdkit.SimDivFilters.SimilarityPickers`
	`rdkit.SimDivFilters.test_list`
	`rdkit.SimDivFilters.UnitTestSimilarityPickers`
	`rdkit.six`
	`rdkit.sping`
	`rdkit.sping.colors`
	`rdkit.sping.pagesizes`
	`rdkit.sping.PDF`
	`rdkit.sping.PDF.pdfdoc`
	`rdkit.sping.PDF.pdfgen`
	`rdkit.sping.PDF.pdfgeom`
	`rdkit.sping.PDF.pdfmetrics`
	`rdkit.sping.PDF.pdfutils`
	`rdkit.sping.PDF.pidPDF`
	`rdkit.sping.pid`
	`rdkit.sping.PIL`
	`rdkit.sping.PIL.pidPIL`
	`rdkit.sping.PS`
	`rdkit.sping.PS.fontinfo`
	`rdkit.sping.PS.latin1MetricsCache`
	`rdkit.sping.PS.pidPS`
	`rdkit.sping.PS.psmetrics`
	`rdkit.sping.Qt`
	`rdkit.sping.Qt.pidQt4`
	`rdkit.sping.ReportLab`
	`rdkit.sping.SVG`
	`rdkit.sping.SVG.pidSVG`
	`rdkit.sping.tests`
	`rdkit.sping.tests.pidtest`
	`rdkit.sping.util`
	`rdkit.sping.utils`
	`rdkit.test_list`
	`rdkit.TestRunner`
	`rdkit.utils`
	`rdkit.utils.cactvs`
	`rdkit.utils.chemutils`
	`rdkit.utils.fileutils`
	`rdkit.utils.listutils`
	`rdkit.utils.spiral`
	`rdkit.utils.test_list`
	`rdkit.utils.UnitTestUtils`
	`rdkit.VLib`
	`rdkit.VLib.Filter`
	`rdkit.VLib.Node`
	`rdkit.VLib.NodeLib`
	`rdkit.VLib.NodeLib.DbMolSupply`
	`rdkit.VLib.NodeLib.DbPickleSupplier`
	`rdkit.VLib.NodeLib.SDSupply`
	`rdkit.VLib.NodeLib.SmartsMolFilter`
	`rdkit.VLib.NodeLib.SmartsRemover`
	`rdkit.VLib.NodeLib.SmilesDupeFilter`
	`rdkit.VLib.NodeLib.SmilesOutput`
	`rdkit.VLib.NodeLib.SmilesSupply`
	`rdkit.VLib.NodeLib.test_list`
	`rdkit.VLib.NodeLib.UnitTestNodeLib`
	`rdkit.VLib.Output`
	`rdkit.VLib.Supply`
	`rdkit.VLib.test_list`
	`rdkit.VLib.Transform`
	`rdkit.VLib.UnitTestVLib`