FragFPGenerator.h

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00003 //
00004 //   @@ All Rights Reserved  @@
00005 //
00006 #ifndef _RD_FRAG_FP_GENERATOR_H_
00007 #define _RD_FRAG_FP_GENERATOR_H_
00008 
00009 #include <vector>
00010 #include <Catalogs/Catalog.h>
00011 #include "FragCatalogEntry.h"
00012 #include "FragCatParams.h"
00013 
00014 class ExplicitBitVect;
00015 namespace RDKit {
00016   class ROMol;
00017   typedef RDCatalog::HierarchCatalog<FragCatalogEntry, FragCatParams, int> FragCatalog;
00018   typedef std::vector< std::pair<int,int> > MatchVectType; 
00019 
00020 
00021   class FragFPGenerator {
00022   public:
00023     FragFPGenerator() {}
00024 
00025     ExplicitBitVect *getFPForMol(const ROMol &mol, const FragCatalog &fcat);
00026 
00027   private:
00028     void computeFP(const ROMol &mol, const FragCatalog &fcat,
00029                    const MatchVectType &aidToFid, ExplicitBitVect *fp);
00030   };
00031 }
00032 
00033 #endif