- a -

• AllBitSimilarity() : BitOps.h
• AllProbeBitsMatch() : BitOps.h
• AsymmetricSimilarity() : BitOps.h

- b -

• Base64Decode() : base64.h
• Base64Encode() : base64.h
• BitVectToText() : BitOps.h
• BraunBlanquetSimilarity() : BitOps.h

- c -

• charPtrCleanup() : SLNParse/InputFiller.h , SmilesParse/InputFiller.h
• convertToExplicit() : BitVectUtils.h
• CosineSimilarity() : BitOps.h

- d -

• DiceSimilarity() : BitOps.h

- f -

• FoldFingerprint() : BitOps.h
• FromBitString() : BitVectUtils.h
• FromDaylightString() : BitVectUtils.h

- i -

• InfoEntropy() : cEntropy.h
• InfoGain() : cEntropy.h
• initcEntropy() : cEntropy.h
• initClustering() : Clustering.h
• initcQuantize() : cQuantize.h

- k -

• KulczynskiSimilarity() : BitOps.h

- m -

• McConnaugheySimilarity() : BitOps.h

- n -

• NumBitsInCommon() : BitOps.h
• NumOnBitsInCommon() : BitOps.h

- o -

• OffBitProjSimilarity() : BitOps.h
• OffBitsInCommon() : BitOps.h
• OnBitProjSimilarity() : BitOps.h
• OnBitSimilarity() : BitOps.h
• OnBitsInCommon() : BitOps.h
• operator*() : Transform3D.h , Transform2D.h , Transform3D.h
• operator<<() : SymmMatrix.h , Matrix.h , Bond.h , Vector.h , Atom.h

- r -

• RusselSimilarity() : BitOps.h

- s -

• setInputCharPtr() : SLNParse/InputFiller.h , SmilesParse/InputFiller.h
• setInputFilePtr() : SmilesParse/InputFiller.h , SLNParse/InputFiller.h
• SimilarityWrapper() : BitOps.h
• SokalSimilarity() : BitOps.h

- t -

• TanimotoSimilarity() : BitOps.h
• TverskySimilarity() : BitOps.h