rdkit.ML.InfoTheory package

Submodules

• rdkit.ML.InfoTheory.BitClusterer module
  • BitClusterer
    • BitClusterer.ClusterBits()
    • BitClusterer.GetClusters()
    • BitClusterer.MapToClusterFP()
    • BitClusterer.MapToClusterScores()
    • BitClusterer.SetClusters()
• rdkit.ML.InfoTheory.BitRank module
  • AnalyzeSparseVects()
  • CalcInfoGains()
  • FormCounts()
  • RankBits()
  • SparseRankBits()
• rdkit.ML.InfoTheory.entropy module
  • PyInfoEntropy()
  • PyInfoGain()
• rdkit.ML.InfoTheory.rdInfoTheory module
  • BitCorrMatGenerator
    • BitCorrMatGenerator.CollectVotes()
    • BitCorrMatGenerator.GetCorrMatrix()
    • BitCorrMatGenerator.SetBitList()
  • InfoBitRanker
    • InfoBitRanker.AccumulateVotes()
    • InfoBitRanker.GetTopN()
    • InfoBitRanker.SetBiasList()
    • InfoBitRanker.SetMaskBits()
    • InfoBitRanker.Tester()
    • InfoBitRanker.WriteTopBitsToFile()
  • InfoType
    • InfoType.BIASCHISQUARE
    • InfoType.BIASENTROPY
    • InfoType.CHISQUARE
    • InfoType.ENTROPY

Module contents

Information Theory functionality