RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
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Here is a list of all namespace functions with links to the namespace documentation for each function:
- g -
generateDepictionMatching2DStructure() :
RDDepict
generateDepictionMatching3DStructure() :
RDDepict
generateErGFingerprintForReducedGraph() :
RDKit::ReducedGraphs
generateMolExtendedReducedGraph() :
RDKit::ReducedGraphs
generateOneProductSet() :
RDKit::ReactionRunnerUtils
genericAtomMatcher() :
RDKit::GenericGroups
get3DDistanceMat() :
RDKit::MolOps
getAdjacencyMatrix() :
RDKit::MolOps
getAlignmentTransform() :
RDKit::MolAlign
getAllAtomIdsForStereoGroup() :
RDKit::Atropisomers
getAllConformerBestRMS() :
RDKit::MolAlign
getAllowNontetrahedralChirality() :
RDKit::Chirality
getAllRotatableBonds() :
RDDepict
getAngleDeg() :
MolTransforms
getAngleRad() :
MolTransforms
getAtomAlias() :
RDKit
getAtomCode() :
RDKit::AtomPairs
getAtomDepictRank() :
RDDepict
getAtomicNumber() :
RDKit::StructureCheck
getAtomLabel() :
RDKit::UFF::Tools
getAtomListQueryVals() :
RDKit
getAtomListText() :
RDKit::MolDraw2D_detail
getAtomPairCode() :
RDKit::AtomPairs
getAtomPairFingerprint() :
RDKit::AtomPairs
getAtomPairGenerator() :
RDKit::AtomPair
getAtomPropertyList() :
RDKit::FileParserUtils
getAtomRLabel() :
RDKit
GetAtomSmarts() :
RDKit::SmartsWrite
GetAtomSmiles() :
RDKit::SmilesWrite
getAtomTypeAtomicNum() :
RDKit
getAtomTypeIsAromatic() :
RDKit
getAtomTypes() :
RDKit::UFF
getAtomValue() :
RDKit
getAtropisomerAtomsAndBonds() :
RDKit::Atropisomers
getAvgMolWt() :
RDKit::MolOps
getBestAlignmentTransform() :
RDKit::MolAlign
getBestRMS() :
RDKit::MolAlign
getBondHighlightsForAtoms() :
RDKit::MolDraw2D_detail
getBondLabels() :
RDKit::RascalMCES::details
getBondLength() :
MolTransforms
GetBondSmarts() :
RDKit::SmartsWrite
GetBondSmiles() :
RDKit::SmilesWrite
getBracketPoints() :
RDKit::MolDraw2D_detail
getBRICSNetworkParams() :
RDKit::ScaffoldNetwork
getChiralAcrossAtom() :
RDKit::Chirality
getChiralAcrossBond() :
RDKit::Chirality
getChiralPermutation() :
RDKit::Chirality
getCleanNumber() :
RDKit
getColourByAtomicNum() :
RDKit::MolDraw2D_detail
getConfDimensions() :
RDKit::MolShapes
getConnectivityInvariants() :
RDKit::MorganFingerprints
getConnectorPattern() :
RDKit::SynthonSpaceSearch::details
getConnectorPatterns() :
RDKit::SynthonSpaceSearch::details
getConnectorPermutations() :
RDKit::SynthonSpaceSearch::details
getConnRegion() :
RDKit::SynthonSpaceSearch
getCountFP() :
RDKit
getCountFPBulk() :
RDKit
getCrippenAtomContribs() :
RDKit::Descriptors
getCXExtensions() :
RDKit::SmilesWrite
getDefaultAbbreviations() :
RDKit::Abbreviations::Utils
getDefaultLinkers() :
RDKit::Abbreviations::Utils
getDefaultTautomerScoreSubstructs() :
RDKit::MolStandardize::TautomerScoringFunctions
getDeprotections() :
RDKit::Deprotect
getDihedralDeg() :
MolTransforms
getDihedralRad() :
MolTransforms
getDiscreteDistMat() :
RDKit
getDistanceMat() :
RDKit::MolOps
getDistFromLTM() :
RDPickers
getDoubleRandomSource() :
RDKit
getEndIterator() :
RDKit
getErGFingerprint() :
RDKit::ReducedGraphs
getExactMolWt() :
RDKit::MolOps
getExperimentalTorsions() :
ForceFields::CrystalFF
getFeatureInvariants() :
RDKit::MorganFingerprints
GetFilterData() :
RDKit
GetFilterProperties() :
RDKit
getFingerprint() :
RDKit::MorganFingerprints
getFingerprintAsBitVect() :
RDKit::MACCSFingerprints
,
RDKit::MorganFingerprints
getFingerprintsForMolsInFile() :
RDKit::MolProcessing
GetFlattenedFunctionalGroupHierarchy() :
RDKit
getFormalCharge() :
RDKit::MolOps
getFP() :
RDKit
getFPBulk() :
RDKit
GetFunctionalGroupHierarchy() :
RDKit
getHashedAtomPairFingerprint() :
RDKit::AtomPairs
getHashedAtomPairFingerprintAsBitVect() :
RDKit::AtomPairs
getHashedFingerprint() :
RDKit::MorganFingerprints
getHashedTopologicalTorsionFingerprint() :
RDKit::AtomPairs
getHashedTopologicalTorsionFingerprintAsBitVect() :
RDKit::AtomPairs
getHighlightBondColour() :
RDKit::MolDraw2D_detail
getHighlightBondWidth() :
RDKit::MolDraw2D_detail
getIdealAngleBetweenLigands() :
RDKit::Chirality
getLabuteAtomContribs() :
RDKit::Descriptors
getLine() :
RDKit
getMaxNbors() :
RDKit::Chirality
getMMFFAngle() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFAngleBendEmpiricalRuleParams() :
RDKit::MMFF
getMMFFArom() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFDef() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFDfsb() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFHerschbachLaurie() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFOop() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFPBCI() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFProp() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFStbn() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFStretchBendType() :
RDKit::MMFF
getMMFFTor() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMMFFVdW() :
RDKit::MMFF::DefaultParameters
getMolAtomPoints() :
RDKit::StructureCheck
GetMolFileBondStereoInfo() :
RDKit::Chirality
GetMolFileSGroupInfo() :
RDKit::SGroupWriting
getMolFormula() :
RDKit::MolOps
getMolFragments() :
RDKit::ScaffoldNetwork::detail
getMolFrags() :
RDKit::MolOps
getMolFragsWithQuery() :
RDKit::MolOps
getMolLinkNodes() :
RDKit::MolEnumerator::utils
getMorganGenerator() :
RDKit::MorganFingerprint
getMostSubstitutedCoreMatch() :
RDKit
getNbrAtomAndBondIds() :
RDDepict
getNumAtomsWithDistinctProperty() :
RDKit::MolOps
GetNumEntries() :
RDKit
GetNumPropertyEntries() :
RDKit
getNumThreadsToUse() :
RDKit
getO3AForProbeConfs() :
RDKit::MolAlign
getPeriodicTableRow() :
RDKit::MMFF
getQueryDetails() :
RDKit::PicklerOps
getRandomGenerator() :
RDKit
getRandomVal() :
RDKit
getRDKitFPGenerator() :
RDKit::RDKitFP
getReactantsFromRGroups() :
RDKit
getReactingAtoms() :
RDKit
getRlabels() :
RDKit
getRotatableBonds() :
RDDepict
getShortestPath() :
RDKit::MolOps
getSizesFromBBs() :
RDKit
getSizesFromReactants() :
RDKit
getSparseCountFP() :
RDKit
getSparseCountFPBulk() :
RDKit
getSparseFP() :
RDKit
getSparseFPBulk() :
RDKit
getStartIterator() :
RDKit
getSubstanceGroups() :
RDKit
getSupplementalSmilesLabel() :
RDKit
getSupplier() :
RDKit::GeneralMolSupplier
GetTag() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< bool >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< double >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< float >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< int >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< std::any >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< std::string >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< std::vector< double > >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< std::vector< float > >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< std::vector< int > >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< std::vector< std::string > >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< std::vector< unsigned int > >() :
RDKit::RDTypeTag
GetTag< unsigned int >() :
RDKit::RDTypeTag
getTopologicalTorsionCode() :
RDKit::AtomPairs
getTopologicalTorsionFingerprint() :
RDKit::AtomPairs
getTopologicalTorsionGenerator() :
RDKit::TopologicalTorsion
getTopologicalTorsionHash() :
RDKit::AtomPairs
getTPSAAtomContribs() :
RDKit::Descriptors
getTrigonalBipyramidalAxialAtom() :
RDKit::Chirality
getTrigonalBipyramidalAxialBond() :
RDKit::Chirality
getTwiceBondType() :
RDKit
getTwoBitCell() :
RDKit::MMFF::Tools
,
RDKit::UFF::Tools
getUFFAngleBendParams() :
RDKit::UFF
getUFFBondStretchParams() :
RDKit::UFF
getUFFInversionParams() :
RDKit::UFF
getUFFTorsionParams() :
RDKit::UFF
getUFFVdWParams() :
RDKit::UFF
getUnfoldedRDKFingerprintMol() :
RDKit
GetUnspecifiedBondType() :
SmilesParseOps
getUnspecifiedQueryBond() :
SmilesParseOps
getUseLegacyStereoPerception() :
RDKit::Chirality
getV1TautomerEnumerator() :
RDKit::MolStandardize
getV3000CTAB() :
RDKit::FileParserUtils
getV3000Line() :
RDKit::FileParserUtils
GetV3000MolFileSGroupLines() :
RDKit::SGroupWriting
getWavyLineSegments() :
RDKit::MolDraw2D_detail
GroupAtomMatcher() :
RDKit::GenericGroups::Matchers
GroupHAtomMatcher() :
RDKit::GenericGroups::Matchers
GroupStarAtomMatcher() :
RDKit::GenericGroups::Matchers
GroupStarHAtomMatcher() :
RDKit::GenericGroups::Matchers
Generated on Sun Dec 22 2024 04:42:58 for RDKit by
1.9.8