RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
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Here is a list of all namespace members with links to the namespace documentation for each member:
- m -
maccsFingerprintVersion :
RDKit::MACCSFingerprints
MAE_ATOM_TYPE :
RDKit::FileParsers::schrodinger
MAE_BOND_DATIVE_MARK :
RDKit::FileParsers::schrodinger
MAE_BOND_PARITY :
RDKit::FileParsers::schrodinger
MAE_ENHANCED_STEREO_STATUS :
RDKit::FileParsers::schrodinger
MAE_RGROUP_LABEL :
RDKit::FileParsers::schrodinger
MAE_STEREO_STATUS :
RDKit::FileParsers::schrodinger
MAKE_PARENT :
RDKit::MolStandardize
makeAAtomQuery() :
RDKit
makeAHAtomQuery() :
RDKit
makeAtomAliphaticQuery() :
RDKit
makeAtomAromaticQuery() :
RDKit
makeAtomExplicitDegreeQuery() :
RDKit
makeAtomExplicitValenceQuery() :
RDKit
makeAtomFormalChargeQuery() :
RDKit
makeAtomHasAliphaticHeteroatomNbrsQuery() :
RDKit
makeAtomHasChiralTagQuery() :
RDKit
makeAtomHasHeteroatomNbrsQuery() :
RDKit
makeAtomHasImplicitHQuery() :
RDKit
makeAtomHasRingBondQuery() :
RDKit
makeAtomHCountQuery() :
RDKit
makeAtomHeavyAtomDegreeQuery() :
RDKit
makeAtomHybridizationQuery() :
RDKit
makeAtomImplicitHCountQuery() :
RDKit
makeAtomImplicitValenceQuery() :
RDKit
makeAtomInNRingsQuery() :
RDKit
makeAtomInRingOfSizeQuery() :
RDKit
makeAtomInRingQuery() :
RDKit
makeAtomIsBridgeheadQuery() :
RDKit
makeAtomIsotopeQuery() :
RDKit
makeAtomMassQuery() :
RDKit
makeAtomMinRingSizeQuery() :
RDKit
makeAtomMissingChiralTagQuery() :
RDKit
makeAtomNegativeFormalChargeQuery() :
RDKit
makeAtomNonHydrogenDegreeQuery() :
RDKit
makeAtomNullQuery() :
RDKit
makeAtomNumAliphaticHeteroatomNbrsQuery() :
RDKit
makeAtomNumHeteroatomNbrsQuery() :
RDKit
makeAtomNumQuery() :
RDKit
makeAtomNumRadicalElectronsQuery() :
RDKit
makeAtomRangeQuery() :
RDKit
makeAtomRingBondCountQuery() :
RDKit
makeAtomSimpleQuery() :
RDKit
makeAtomTotalDegreeQuery() :
RDKit
makeAtomTotalValenceQuery() :
RDKit
makeAtomType() :
RDKit
makeAtomTypeQuery() :
RDKit
makeAtomUnsaturatedQuery() :
RDKit
makeBondDirEqualsQuery() :
RDKit
makeBondHasStereoQuery() :
RDKit
makeBondInNRingsQuery() :
RDKit
makeBondInRingOfSizeQuery() :
RDKit
makeBondIsInRingQuery() :
RDKit
makeBondMinRingSizeQuery() :
RDKit
makeBondNullQuery() :
RDKit
makeBondOrderEqualsQuery() :
RDKit
makeDoubleOrAromaticBondQuery() :
RDKit
MakeFilterCatalogEntry() :
RDKit
makeHasPropQuery() :
RDKit
makeMAtomQuery() :
RDKit
makeMHAtomQuery() :
RDKit
makeParent() :
RDKit::MolStandardize::Operations
makePropertyQuery() :
RDKit::Descriptors
makePropertyRangeQuery() :
RDKit::Descriptors
makePropQuery() :
RDKit
makeQAtomQuery() :
RDKit
makeQHAtomQuery() :
RDKit
makeRingNeighborMap() :
RingUtils
makeScaffoldGeneric() :
RDKit::ScaffoldNetwork::detail
makeSingleOrAromaticBondQuery() :
RDKit
makeSingleOrDoubleBondQuery() :
RDKit
makeSingleOrDoubleOrAromaticBondQuery() :
RDKit
makeXAtomQuery() :
RDKit
makeXHAtomQuery() :
RDKit
markUnspecifiedStereoAsUnknown() :
RDKit
marvinBondOrders :
RDKit
marvinConventionTypes :
RDKit
marvinQueryBondsTypes :
RDKit
marvinRadicalToRadicalElectrons :
RDKit
marvinRadicalVals :
RDKit
marvinStereoConventionTypes :
RDKit
marvinStereoDictRefTypes :
RDKit
massIntegerConversionFactor :
RDKit
match_V_t :
RDKit::FMCS
MatchTable :
RDKit::FMCS
MatchVectType :
RDKit
MAX_BONDTYPE :
RDKit::Canon
MAX_COLL_ITERS :
RDDepict
MAX_CONNECTOR_NUM :
RDKit::SynthonSpaceSearch
MAX_CYCLES :
RDKit::Canon
MAX_DOUBLE :
RDKit
MAX_INT :
RDKit
MAX_LONGINT :
RDKit
MAX_NATOMS :
RDKit::Canon
maxAttachIdx :
RDKit::common_properties
MaxDouble :
RDKit::RDTypeTag
maxFingerprintLayers :
RDKit
MAXITS :
BFGSOpt
maxNumBranches :
RDKit::AtomPairs
maxNumPi :
RDKit::AtomPairs
maxPathLen :
RDKit::AtomPairs
MAXSTEP :
BFGSOpt
MCSAcceptanceFunction :
RDKit
MCSAtomCompareAny() :
RDKit
MCSAtomCompareAnyHeavyAtom() :
RDKit
MCSAtomCompareElements() :
RDKit
MCSAtomCompareFunction :
RDKit
MCSAtomCompareIsotopes() :
RDKit
MCSBondCompareAny() :
RDKit
MCSBondCompareFunction :
RDKit
MCSBondCompareOrder() :
RDKit
MCSBondCompareOrderExact() :
RDKit
MCSFinalMatchCheckFunction :
RDKit
MCSProgressCallback :
RDKit
MCSProgressCallbackTimeout() :
RDKit
MDYNE_A_TO_KCAL_MOL :
ForceFields::MMFF
meanBondLength() :
RDKit::MolDraw2DUtils
mergeNullQueries() :
RDKit
mergeQueryHs() :
RDKit::MolOps
mhfpFingerprintVersion :
RDKit::MHFPFingerprints
minimize() :
BFGSOpt
MINIMIZE_FOURTH_DIMENSION :
RDKit::DGeomHelpers
minRingSizeForDoubleBondStereo :
RDKit::Chirality
MMFF_VERBOSITY_HIGH :
RDKit::MMFF
MMFF_VERBOSITY_LOW :
RDKit::MMFF
MMFF_VERBOSITY_NONE :
RDKit::MMFF
MMFFAtomPropertiesPtr :
RDKit::MMFF
MMFFOptimizeMolecule() :
RDKit::MMFF
MMFFOptimizeMoleculeConfs() :
RDKit::MMFF
Mol2BlockToMol() :
RDKit::v1
Mol2DataStreamToMol() :
RDKit::v1
Mol2FileToMol() :
RDKit::v1
Mol2Type :
RDKit::v2::FileParsers
MOL_PTR_VECT :
RDKit
MOL_PTR_VECT_CI :
RDKit
MOL_PTR_VECT_I :
RDKit
MOL_SPTR_VECT :
RDKit
MOL_STACK_ATOM :
RDKit::Canon
MOL_STACK_BOND :
RDKit::Canon
MOL_STACK_BRANCH_CLOSE :
RDKit::Canon
MOL_STACK_BRANCH_OPEN :
RDKit::Canon
MOL_STACK_RING :
RDKit::Canon
MOL_VECT :
RDKit
molAtomClass :
RDKit::common_properties
molAtomMapNumber :
RDKit::common_properties
molAtomSeqId :
RDKit::common_properties
molAttachOrder :
RDKit::common_properties
molAttachPoint :
RDKit::common_properties
MolBlockToMol() :
RDKit::v1
MolBundleCanSerialize() :
RDKit
MolCatalog :
RDKit
MolDataStreamToMol() :
RDKit::v1
molFileAlias :
RDKit::common_properties
MolFileComments :
RDKit::common_properties
MolFileInfo :
RDKit::common_properties
molFileLinkNodes :
RDKit::common_properties
MolFileToMol() :
RDKit::v1
molFileValue :
RDKit::common_properties
MolFragmentToCXSmarts() :
RDKit
MolFragmentToCXSmiles() :
RDKit
MolFragmentToSmarts() :
RDKit
MolFragmentToSmiles() :
RDKit
MolFromMol2Block() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromMol2DataStream() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromMol2File() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromMolBlock() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromMolDataStream() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromMolFile() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromMrvBlock() :
RDKit::v2::MarvinParser
MolFromMrvDataStream() :
RDKit::v2::MarvinParser
MolFromMrvFile() :
RDKit::v2::MarvinParser
MolFromPDBBlock() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromPDBDataStream() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromPDBFile() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromTPLDataStream() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromTPLFile() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromXYZBlock() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromXYZDataStream() :
RDKit::v2::FileParsers
MolFromXYZFile() :
RDKit::v2::FileParsers
MolGraph :
RDKit
MolHash() :
RDKit::MolHash
molInversionFlag :
RDKit::common_properties
molNote :
RDKit::common_properties
molParity :
RDKit::common_properties
molReactStatus :
RDKit::common_properties
molRingBondCount :
RDKit::common_properties
molRxnComponent :
RDKit::common_properties
molRxnExactChange :
RDKit::common_properties
molRxnRole :
RDKit::common_properties
MolsFromCDXML() :
RDKit::v2::CDXMLParser
MolsFromCDXMLDataStream() :
RDKit::v2::CDXMLParser
MolsFromCDXMLFile() :
RDKit::v2::CDXMLParser
MolStack :
RDKit::Canon
MolStackTypes :
RDKit::Canon
molStereoCare :
RDKit::common_properties
MolsToJSONData() :
RDKit::MolInterchange
molSubstCount :
RDKit::common_properties
molTag :
RDKit::PNGData
MolToCMLBlock() :
RDKit
MolToCMLFile() :
RDKit
MolToCXSmarts() :
RDKit
MolToCXSmiles() :
RDKit
MolToFASTA() :
RDKit
MolToHELM() :
RDKit
MolToJSONData() :
RDKit::MolInterchange
MolToMolBlock() :
RDKit
MolToMolFile() :
RDKit
MolToMrvBlock() :
RDKit
MolToMrvFile() :
RDKit
MolToPDBBlock() :
RDKit
MolToPDBFile() :
RDKit
MolToRandomSmilesVect() :
RDKit
MolToSequence() :
RDKit
MolToSmarts() :
RDKit
MolToSmiles() :
RDKit
,
RDKit::SmilesWrite::detail
MolToTPLFile() :
RDKit
MolToTPLText() :
RDKit
molTotValence :
RDKit::common_properties
MolToV2KMolBlock() :
RDKit
MolToV3KMolBlock() :
RDKit
MolToV3KMolFile() :
RDKit
MolToXYZBlock() :
RDKit
MolToXYZFile() :
RDKit
molzip() :
RDKit
MolzipLabel :
RDKit
morganConnectivityInvariantVersion :
RDKit::MorganFingerprints
morganFeatureInvariantVersion :
RDKit::MorganFingerprints
morganFingerprintVersion :
RDKit::MorganFingerprints
moveAdditionalPropertiesToSGroups() :
RDKit::FileParserUtils
moveToFunction() :
RDKit::MolDraw2D_detail
MOVETOL :
BFGSOpt
MQNVersion :
RDKit::Descriptors
MRV_SMA :
RDKit::common_properties
MrvBlockIsReaction() :
RDKit::v1
,
RDKit::v2::MarvinParser
MrvBlockToChemicalReaction() :
RDKit::v1
MrvBlockToMol() :
RDKit::v1
MrvDataStreamIsReaction() :
RDKit::v1
,
RDKit::v2::MarvinParser
MrvDataStreamToChemicalReaction() :
RDKit::v1
MrvDataStreamToMol() :
RDKit::v1
MrvFileIsReaction() :
RDKit::v1
,
RDKit::v2::MarvinParser
MrvFileToChemicalReaction() :
RDKit::v1
MrvFileToMol() :
RDKit::v1
MultiColourHighlightStyle :
RDKit
multiply() :
RDNumeric
MurckoDecompose() :
RDKit
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1.9.8