RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
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Here is a list of all namespace members with links to the namespace documentation for each member:
- p -
PAIR_D_I_I :
RDDepict
PAIR_I_I :
RDDepict
pairGreater :
Rankers
pairLess :
Rankers
paramData :
RDKit
ParentOperation :
RDKit::MolStandardize::Operations
parse() :
RDKit::MolStandardize::Operations
parseAbbreviations() :
RDKit::Abbreviations::Utils
parseAdjustQueryParametersFromJSON() :
RDKit::MolOps
parseAtomAttribs() :
RDKit::SLNParse
parseAtomType() :
RDKit
parseBondAttribs() :
RDKit::SLNParse
parseCXExtensions() :
SmilesParseOps
parseFeatureData() :
RDKit
parseFeatureFile() :
RDKit
parseFinalAtomAttribs() :
RDKit::SLNParse
parseFinalBondAttribs() :
RDKit::SLNParse
parseLinkers() :
RDKit::Abbreviations::Utils
parseMCSParametersJSON() :
RDKit
parseMolAttribs() :
RDKit::SLNParse
ParseOperation :
RDKit::MolStandardize::Operations
parseOptionsJSON() :
RDKit::StructureCheck
parseQueryDefFile() :
RDKit
parseQueryDefText() :
RDKit
ParseSGroupDoubleField() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupIntField() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SAPLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SBTLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SBVLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SCDSEDLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SCLLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SCNLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SDDLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SDILine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SDSLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SDTLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SLBLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SMTLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SNCLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SPLLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000SSTLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000STYLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseSGroupV2000VectorDataLine() :
RDKit::SGroupParsing
ParseV2000CTAB() :
RDKit::FileParserUtils
ParseV3000Array() :
RDKit::SGroupParsing
ParseV3000CStateLabel() :
RDKit::SGroupParsing
ParseV3000CTAB() :
RDKit::FileParserUtils
ParseV3000SAPLabel() :
RDKit::SGroupParsing
ParseV3000SGroupsBlock() :
RDKit::SGroupParsing
ParseV3000StringPropLabel() :
RDKit::SGroupParsing
PARSING_INPUT :
RDKit::MolStandardize
PATH_LIST :
RDKit
PATH_LIST_CI :
RDKit
PATH_TYPE :
RDKit
pathToSubmol() :
RDKit::Subgraphs
PatternFingerprintMol() :
RDKit
PatternFingerprintMolVersion :
RDKit
patternFingerprintTargetMol() :
RDKit::GeneralizedSubstruct
PDB_ATOM_NAME :
RDKit::FileParsers::schrodinger
PDB_CHAIN_NAME :
RDKit::FileParsers::schrodinger
PDB_INSERTION_CODE :
RDKit::FileParsers::schrodinger
PDB_OCCUPANCY :
RDKit::FileParsers::schrodinger
PDB_RESIDUE_NAME :
RDKit::FileParsers::schrodinger
PDB_RESIDUE_NUMBER :
RDKit::FileParsers::schrodinger
PDB_TFACTOR :
RDKit::FileParsers::schrodinger
PDBBlockToMol() :
RDKit::v1
PDBDataStreamToMol() :
RDKit::v1
PDBFileToMol() :
RDKit::v1
periodicTableAtomData :
RDKit
PermissiveRingFusion :
RDKit
permMFromN() :
RDKit::SynthonSpaceSearch::details
PhiVersion :
RDKit::Descriptors
pickBondsToWedge() :
RDKit::Chirality
pickBondToWedge() :
RDKit::Chirality::detail
pickFirstRingToEmbed() :
RDDepict
pickFusedRings() :
RingUtils
pickle() :
RDKit::EnumerationStrategyPickler
pickRandomDistMat() :
DistGeom
PipelineLog :
RDKit::MolStandardize
PipelineStage :
RDKit::MolStandardize
PipelineVector :
RDKit::MolStandardize::Operations
pklTag :
RDKit::PNGData
PNGFileToChemicalReaction() :
RDKit::v1
PNGFileToMetadata() :
RDKit
PNGFileToMol() :
RDKit
PNGFileToMols() :
RDKit
PNGStreamToChemicalReaction() :
RDKit::v1
PNGStreamToMetadata() :
RDKit
PNGStreamToMol() :
RDKit
PNGStreamToMols() :
RDKit
PNGStringToChemicalReaction() :
RDKit::v1
PNGStringToMetadata() :
RDKit
PNGStringToMol() :
RDKit
PNGStringToMols() :
RDKit
Point2DPtrVect :
RDGeom
Point2DPtrVect_CI :
RDGeom
Point2DPtrVect_I :
RDGeom
POINT3D_VECT :
RDGeom
POINT3D_VECT_CI :
RDGeom
POINT3D_VECT_I :
RDGeom
Point3DConstPtrVect :
RDGeom
Point3DConstPtrVect_CI :
RDGeom
Point3DConstPtrVect_I :
RDGeom
Point3DPtrVect :
RDGeom
Point3DPtrVect_CI :
RDGeom
Point3DPtrVect_I :
RDGeom
PointPtrVect :
RDGeom
PointPtrVect_CI :
RDGeom
PointPtrVect_I :
RDGeom
PositionConstraintContrib :
ForceFields::MMFF
,
ForceFields::UFF
PossibleType :
RDKit::Canon
powerEigenSolver() :
RDNumeric::EigenSolvers
PR_QUEUE :
RDDepict
preferCoordGen :
RDDepict
PREPARE_FOR_STANDARDIZATION :
RDKit::MolStandardize
PREPARE_FOR_VALIDATION :
RDKit::MolStandardize
prepareAndDrawMolecule() :
RDKit::MolDraw2DUtils
prepareForStandardization() :
RDKit::MolStandardize::Operations
prepareForValidation() :
RDKit::MolStandardize::Operations
prepareMol() :
RDKit
prepareMolForDrawing() :
RDKit::MolDraw2DUtils
prepareTemplateForRGroups() :
RDDepict
preprocessReaction() :
RDKit
preserveOrigIndices() :
RDKit::MolEnumerator::detail
prime :
RDKit::MHFPFingerprints::FNV
printAtomMatches() :
RDKit::RascalMCES::details
printBondMatches() :
RDKit::RascalMCES::details
printScores() :
RDKit::RascalMCES::details
printSyntaxErrorMessage() :
SmilesParseOps::detail
processMolPropertyList() :
RDKit::FileParserUtils
processMolPropertyLists() :
RDKit::FileParserUtils
Product :
RDKit
PROP_AND_QUERY :
RDKit::Descriptors
PROP_BOOL_QUERY :
RDKit::Descriptors
PROP_EQUALS_QUERY :
RDKit::Descriptors
PROP_GREATER_QUERY :
RDKit::Descriptors
PROP_GREATEREQUAL_QUERY :
RDKit::Descriptors
PROP_LESS_QUERY :
RDKit::Descriptors
PROP_LESSEQUAL_QUERY :
RDKit::Descriptors
PROP_OR_QUERY :
RDKit::Descriptors
PROP_RANGE_QUERY :
RDKit::Descriptors
PROP_XOR_QUERY :
RDKit::Descriptors
propertyCompat() :
RDKit
protrudeDistance() :
RDGeom
,
RDKit::MolShapes
pruneMol() :
RDKit::ScaffoldNetwork::detail
PtrTag :
RDKit::RDTypeTag
pullPackedIntFromString() :
RDKit
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1.9.8